Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnft2Q3UF64 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms