Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms