Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cops9Q3U898 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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