Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc9Q3U0M1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms