Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc28Q3TX51 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms