Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3TTL0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms