Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms