Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pi4k2aQ2TBE6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pi4k2aQ2TBE6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms