Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd9Q14BI7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd9Q14BI7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms