Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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