Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VgfQ0VGU4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VgfQ0VGU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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