Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms