Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5bQ0V8T8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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