Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kndc1Q0KK55 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms