Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc21bQ0HA38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc21bQ0HA38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms