Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cnn2Q08093 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnn2Q08093 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnn2Q08093 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn2Q08093 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnn2Q08093 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnn2Q08093 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn2Q08093 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cnn2Q08093 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms