Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnn1Q08091 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnn1Q08091 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms