Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms