Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox13Q04891 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms