Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox12Q04890 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms