Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd1Q02242 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms