Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms