Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp1Q00915 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms