Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Nkx2-3P97334 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-3P97334 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms