Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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