Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx1P81068 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx1P81068 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms