Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms