Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbx6P70327 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms