Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NficP70255 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NficP70255 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NficP70255 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NficP70255 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NficP70255 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NficP70255 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NficP70255 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms