Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms