Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DccP70211 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DccP70211 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DccP70211 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DccP70211 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DccP70211 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DccP70211 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DccP70211 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DccP70211 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DccP70211 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DccP70211 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DccP70211 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DccP70211 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DccP70211 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DccP70211 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DccP70211 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DccP70211 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DccP70211 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DccP70211 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DccP70211 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms