Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms