Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4bP68372 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms