Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbdP63072 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UbdP63072 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbdP63072 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbdP63072 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbdP63072 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UbdP63072 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms