Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab3cP62823 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab3cP62823 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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