Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps11P62281 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps11P62281 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms