Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5r1P61809 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms