Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga11P61622 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga11P61622 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms