Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm2P58774 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms