Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpa1P57784 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpa1P57784 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms