Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsc2P56916 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms