Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd5P56812 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms