Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtskP55097 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtskP55097 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtskP55097 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtskP55097 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtskP55097 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtskP55097 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtskP55097 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms