Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms