Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Faf1P54731 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms