Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad23bP54728 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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