Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd1P52734 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms