Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cav1P49817 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cav1P49817 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms