Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcls1P49710 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms