Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptx3P48759 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms